研究室概要
生物機能構造分野では、ペプチドを中心とした生体関連人工機能性分子の有機合成を主に行っています。生物有機化学です。生体機能に関わる化合物を有機合成し、生体機能を調べます。
内容の一部を更新しました(3/21)。２分間研究室紹介すみません内容改訂中です。
研究内容 (進学予定学生さん向け。近年の論文等はResearchmapをご覧ください。)
１．機械学習を用いた、アンジオテンシン変換酵素阻害能を持つ ペプチドの探索研究。 
既知配列の阻害データをもとに、機械学習で阻害能を予測して合成し、検証します。
縦軸-G-横軸のトリペプチドとその阻害強度の既知データを表した上の図のように、調べられている阻害データはあまりありません。阻害データがあるペプチドとアンジオテンシン変換酵素との相互作用を統合計算化学システムMOEを使用して計算し、さらに機械学習を用いて阻害能を推測します。
これから必要となっていく「人工知能」的な手法と、実際に化合物を合成して現実世界で結果を見出すことが両方体験できます。
２．非天然アミノ酸を利用した、プロテアーゼを区別するための新規蛍光基質の開発 (図は簡易化しています)
上図のような、プロテアーゼをより正確に検出できる基質を設計合成します。
３．近赤外蛍光物質を用いたプロテアーゼ検出化合物の設計合成 パンディー研究室と共同で、透過率が高い近赤外蛍光物質を用いてプロテアーゼ活性を検出する化合物を設計合成します。
検出しやすくなるだけでなく、酵素活性のイメージングなどに応用できます。
近況
更新が無いと様子がわからなくて寂しいとのツッコミを卒業生から頂いたので順に過去に向けても更新していきます。（写真はあとから） 2024年 3月19日 日本化学会第104春季年会で、博士前期課程学生の田中さんが発表しました（１．の研究）。21日に博士後期課程学生のGupta君、Priyankaさん（いずれも３．の研究）、博士前期課程学生の本祥君（２．の研究）が発表します。
2024年 3月1日今年度の博士修了、修士修了者の送別会を行いました。 2024年 2月21日 修士論文発表会が行われ、博士前期課程二年の藤本君が修士論文発表を行いました。 2024年 1月31日 社会人博士後期課程の畠中君の博士論文公聴会を行いました。 2023年 11月 社会人博士後期課程の畠中君、博士前期課程の藤本君の論文がLetters in Drug Design & Discovery
誌に掲載されました。機械学習を用いてアンジオテンシン変換酵素の阻害ペプチドを見出す研究です。
2023年 11月 博士後期修了山脇君の論文がResults in Chemistry 誌に掲載されました。非天然アミノ酸を用いて異種のプロテアーゼの区別をつける方法の研究です。
2023年 11月 博士後期課程学生のGupta君、Priyankaさん、博士前期課程学生の本祥君、田中さんがマレーシSAESシンポジウムで発表しました。 2023年 6月 博士後期課程学生Gupta君の論文がPhysica Status Solidi (A) Applications and
Materials Science 誌に掲載されました。パンディー研究室の色素を応用した共同研究です。
2023年 7月下旬 M1本祥君の誕生会を行いました。 2023年 7月1日 化学関連支部合同九州大会で、博士後期課程のグプタ君、プリヤンカさん、博士前期（修士）課程２年の藤本君がポスター発表を行いました。 2023年 6月24-29日 社会人博士後期課程の畠中君がAPS2023（米国ペプチド学会、アリゾナ）でポスター発表を行いました。 2023年 5月中旬 博士後期課程のプリヤンカさんと修士課程２年の藤本君の誕生会を行いました。 2023年 4月 社会人博士後期課程の畠中君の論文がMolecules誌に掲載されました。 2023年 3月24日 博士後期期課程３年の山脇君の博士学位授与式、卒業式、博士前期課程二年の成松君と野溝君の学位授与式が行われました。 2023年 2月28日 卒業式前のFarewell Partyと成松君の誕生会を行いました（not会食）。 2023年 2月15日 修士論文発表会が行われ、博士前期課程二年の成松君と野溝君が修士論文発表を行いました。 2023年 1月18日 博士後期期課程３年の山脇君の博士論文公聴会を行いました。 2023年 1月10日 今年の実験はじめです。 2022年 12月28日 今年の実験終了です。―後日追加更新予定―
2022年 2月15日 修士論文発表会が行われ、博士前期課程二年の川上さんが修士論文発表を行いました。 12月5日 SAES2021で博士前期課程二年の川上さんが発表し、ポスター賞を受賞しました。 12月22日 今年は実験日はここまでで、あとは大掃除です。 12月3日 北九州市内のコロナウイルス感染症もだいぶおさまってきたのでまとめて誕生日会（not会食）を行いました。 3月26日 今年度博士後期課程修了のHisham君の修了祝い（not会食）を行いました。 3月21日 日本化学会第101春季年会で、博士前期課程二年の川上さんが発表しました。今年はオンラインなので研究室からの発表です。 3月11日 卒業生（博士後期）の佐藤君が研究室に遊びに来ました。米国のポスドク生活もコロナで大変だったようです。 2月5日 博士後期課程3年のHisham君が筆頭著者の ”Design, Synthesis and Antibacterial Studies
of Novel Cationic Amphipathic Cyclic Undecapeptides and Their Linear Counterparts
against Virulent Bacterial Strains"（Hisham N. Farrag,Toshinari Maeda
andTamaki Kato )がSci. Pharm. 誌に掲載されました。こちらは普通に誤字修正などのあとに公開されたので前の論文と順番が入れ替わっています。 2021年1月28日 博士後期課程２年の山脇君が筆頭著者の ”The Effect of a Peptide Substrate Containing
an Unnatural Branched Amino Acid on Chymotrypsin Activity” （Yuuki Yamawaki,Tomoki
Yufu andTamaki Kato )がProcesses誌に掲載されました。アクセプトの翌日には仮公開されてびっくりしました。 12月31日 博士後期課程3年のHisham君が筆頭著者の ”Design and Synthesis of a New Amphipathic
Cyclic Decapeptide with Rapid, Stable, and Continuous Antibacterial Effects"
(Hisham N. Farrag, Khaled Metwally, Shinya Ikeno and Tamaki Kato )がPertanika
J. Sci. & Technol. 誌に掲載されました。 この間に、９月スペインのヨーロッパペプチド学会は一年延期、１１月の第５７回ペプチド討論会（鳥取からオンラインへ変更）ではHisham君と山脇君が発表しました。４月９日 新型コロナウイルス感染症のため休止中。３月２５日 卒業式/学位記授与式が行われました。２月２６日 ３月２２日から月２５日まで行われる予定だった日本化学会 第100春季年会が中止となりました。博士後期課程１年の山脇君の発表が３月５日をもって成立、ということになりました。
３月２日 今月誕生日の人の誕生日会の予定だったのですが、コロナ自粛下で個別に切って静かにいただきました。
２月１８日 修士論文発表会で、博士前期課程２年の大西君、川畑君、油布君、平坂君、平野君が修士論文発表を行いました。２０２０年１月１１日 卒業生の佐藤君（米国ノースカロライナ州立大学博士研究員）の一時帰国に合わせ、同期ののキラン君（国内企業研究員）を交えて近くのインド料理店でが歓迎会を行いました。
５月２１日 修士論文中間発表会で、博士前期課程２年の大西君、川畑君、油布君、平坂君、平野君が修士論文中間発表を行いました。３月２５日 卒業式/学位記授与式が行われました。３月１６日-３月１９日 日本化学会 第99春季年会 (2019)で博士前期課程１年の大西君、川畑君、油布君が発表しました。２０１９年１月２３日 研究員の佐藤君が米国ノースカロライナ州立大学に博士研究員として転職するので、送別会を開きました。
１２月２６日 研究室の忘年会を行いました。
８月２６日-３１日 The 35th European Peptide Symposium （第３５回ヨーロッパペプチド学会（Dublin City
University, Dublin, Ireland ）に参加しました。社会人博士学生の畠中さんがポスター発表を行いました。５月２１日 修士論文中間発表会で、博士前期課程２年の石﨑さん、張さん、品川君が修士論文中間発表を行いました。５月１９日 生命体工学研究科棟でオープンキャンパスを行いました。工学部応用化学科、情報工学部生命情報工学科の学生さんに研究室紹介を行いました。
４月２３日 研究員の佐藤君と社会人博士学生の畠中さんの誕生日会を行いました。
４月９日 研究室の新入生歓迎会を行いました。３月２０日-３月２３日 日本化学会 第97春季年会 (2017)で博士前期課程１年の石﨑さんと張さんが発表しました。２月２０日 修士論文発表会で、博士前期課程２年の橋本君が修士論文発表を行いました。６月１７日-２２日 The 25th American Peptide Symposium（第２５回アメリカペプチド学会（Whistler, British Columbia, Canada ）に参加しました。博士後期課程３年の佐藤君がポスター発表を行いました。５月１３日 生命体工学研究科棟でオープンキャンパスを行いました。工学部応用化学科、情報工学部生命情報工学科の学生さんに研究室紹介を行いました。
４月７日 研究室の新入生歓迎会を行いました。(留学生２名は帰省中)
３月２８日 飯塚キャンパスで行われた、生命の起源および進化学会 第42回学術講演会 (2017)で博士後期課程の佐藤君が「環状ペプチド中のD-アミノ酸」について発表しました。
３月１６日-３月１９日 日本化学会 第97春季年会 (2017)で博士前期課程１年の橋本君とヒシャム君が発表しました。
２月２０日 修士論文発表会で、博士前期課程２年の北村君、清水君、古川君が修士論文発表を行いました。
１月１１日 博士後期課程年のキラン君が筆頭著者の"Photophysical characterization and BSA interaction
of the direct ring carboxy functionalized unsymmetrical NIR cyanine dyes"が、Dyes
and Pigments誌で公開されました。(Dyes and Pigments, Volume 140, May 2017, Pages 6–13)１２月１７日 戸畑キャンパスで行われた SAES 2016 で、博士後期課程のキラン君が発表を行いました。１２月１４日-１６日 12 th International conference on Nano-molecular Electronics（神戸）で、博士後期課程のキラン君が発表を行いました。１１月４日 修士論文中間発表会（第二陣）で、博士前期課程２年の古川君と清水君が修士論文中間発表を行いました。１０月２０日 博士後期課程年の佐藤君が筆頭著者の"Novel fluorescent substrates for detection
of trypsin activity and inhibitor screening by self-quenching"が、Bioorganic
& Medicinal Chemistry Letters誌で公開されました。(Bioorganic & Medicinal
Chemistry Letters, Volume 26, Issue 23, 1 December 2016, Pages 5736–5740)９月４日-９日 第３４回ヨーロッパペプチド学会(34th European Peptide Symposium and the 8th International Peptide Symposium、ドイツ ライプチヒ)で、博士後期課程の佐藤君が発表
（DETECTION OF PROTEASE ACTIVITY USING INTRAMOLECULAR EXCIMER FORMING BISPYRENE
PEPTIDE SUBSTRATES）を行いました。５月１４日 生命体工学研究科棟でオープンキャンパスを行いました。５月１０日 修士論文中間発表会（第一陣）で、博士前期課程２年の北村君が修士論文中間発表を行いました。１２月にIJEGMBEで発表したキラン君の論文がJournal of Physics: Conference Seriesで公表されました。４月６日 2016年度研究室開始３月２４日-２７日 日本化学会年会（同志社大学京田辺キャンパス）に参加しました。博士後期課程２年のキラン君、佐藤君、博士前期課程１年の北村君と清水君が発表しました。
１２月９日-１１日 India-Japan Expert Group Meeting on Biomolecular Electronics
& Organic Nanotechnology for Environment Preservation (IJEGMBE-2015)
（戸畑キャンパス ）に参加しました。博士後期課程２年のキラン君と佐藤君が口頭発表を行いました。１２月９日-１１日 The 7th International Peptide Symposium（第７回国際ペプチド学会（シンガポール ）に参加しました。博士後期課程２年の佐藤君がポスター発表を行いました。
６月２０日-２４日 American Peptide Society's 24th International Symposium（米国ペプチド学会第２４回国際シンポジウム（Hyatt
Regency Grand Cypress（フロリダ州オーランド） ）に参加しました。博士後期課程２年の佐藤君がポスター発表を行いました。左（上）から二枚はポスター発表会場の様子。続いて会場のホテル外観、学会の受付です。
５月２０日 修士論文中間発表会で、博士前期課程２年の越野さん、近藤君、丸岡君が修士論文中間発表を行いました。５月１６日 生命体工学研究科棟でオープンキャンパスを行いました。以前に博士後期課程を修了（西野研）した学生（現ラジャヒ大学教員）との共同研究の論文が、Bioorganic Chemistry誌で発表されました。４月６日 2015年度研究室開始３月２６日-２９日 日本化学会年会（日大船橋キャンパス）に参加しました。研究発表を博士後期課程１年の佐藤君とキラン君が行いました。
３月６日 卒論発表会（工学部応用化学）で、学部４年生の古川君が卒論発表を行いました。2月24日 修士論文発表会で、博士前期課程２年の甲斐君が修士論文発表を行いました。１２月２２日 研究室の忘年会を行いました。以前に博士後期課程を修了（西野研）した学生（現ラジャヒ大学教員）との共同研究の論文が、Bioorganic Chemistry, Bioorganic
& Medicinal Chemistry, およびAmino Acid誌で発表されました。８月３日-５日 第46回若手ペプチド夏の勉強会（京都府立青少年海洋センター（マリーンピア） ）に参加しました。研究室紹介とポスター発表は博士後期課程１年の佐藤君が行いました。
５月２８日-３０日 第63回高分子学会年次大会（名古屋国際会議場）で、博士後期課程１年の佐藤君が発表しました。
PEPTIDE SCIENCE 2013に４報の研究成果（うち２件は共同研究）を発表しました。４月７日 研究室の新入生歓迎会を行いました。３月２７日 日本化学会第９４春季年会（名古屋大学東山キャンパス）で、博士前期課程１年の丸岡君が発表しました。
３月２４日 研究室の送別会を開催しました。２月５日 博士後期課程３年の遅君が公聴会を行いました。１月３１日 博士後期課程３年の遅君が筆頭著者の"A convenient preparation of Ne-methyl-L-lysine
derivatives and its application to the synthesis of histone tail peptides"が、Amino
Acids誌に受理されました。１月６日 博士後期課程３年の遅君が筆頭著者の"Design and synthesis of peptide-MCA substrates
for a novel assay of histone methyltransferases and their inhibitors"が、Bioorganic
& Medicinal Chemistry誌に受理されました。(Bioorganic & Medicinal Chemistry
22 (2014) 1268-1275, 2/15追記)１月６日 新年会を行いました。１１月６日～８日 APIPS 2013（第５０回ペプチド討論会）で、博士後期課程２年の武さんと博士前期課程2年の佐藤君が発表しました。
１０月１日 マレーシアで行われたSAES 2013で博士前期課程２年の佐藤君が発表を行いました。９月２７日 博士前期課程２年の王さん（9月修了）のさよならパーティーを行いました。
９月９日 博士前期課程のプロジェクト研究発表会を行いました。６月４日 博士前期課程の中間発表会を行いました。５月１８日 生命体工学研究科棟でオープンキャンパスを行いました。
４月３０日 某製薬会社に就職した修了生の後藤さんが研究室来訪。みんなでピザを買いに行きました。
４月８日 新入生歓迎会。博士前期１年生と研究室配属の学部４年生の歓迎会を行いました。
３月２５日 卒業式/学位授与式 ４名の博士前期２年の学生がそれぞれ就職先の会社に巣立って行きました。
３月２２日から立命館大学びわこ・くさつキャンパスで行われた日本化学会第93春季年会(2013)において、博士前期課程１年の山本君、佐藤君、古賀君、王さんが口頭発表を行いました。
研究テーマ
現在主に行っている研究テーマは以下の４つです。
詳しい内容については以下をクリックしてください。
最新の研究内容はこのページ一番上にあります。以下の(i)と(iii)を合併して1.から3.に発展させています。
(i)蛍光を使用した新しいタンパク質分解酵素の検出法の開発 (ii)コラーゲンの立体構造を光でコントロールするシステムの構築 (iii)新規なタンパク質分解酵素活性検出試薬/システムの設計と合成（酵素基質となる蛍光性化合物の設計合成）ページは作成中です、現在はヒューマンライフＩＴ開発センターのページにリンクしています (iv)環状ペプチド積層によるペプチドナノチューブ構造体 (環状ペプチドの合成と溶液からのナノ構造体形成)